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空间转录组学与遗传变异分析

本视频介绍了空间转录组学在遗传变异分析中的应用,重点讲解了如何利用空间转录组数据结合全基因组关联分析(GWAS)数据来鉴定与人类性状相关的细胞类型,并描绘这些细胞在空间中的分布。

主要内容包括:

  • 空间转录组学的基本原理和常用平台。
  • 介绍了一种新的计算方法——GAMA,用于整合遗传数据和空间转录组数据。
  • 如何利用GAMA方法定义细胞的Marker基因,并将其与遗传变异关联。
  • 阐述了如何通过空间邻近性分析来识别与性状相关的细胞簇。

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